Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RtcbQ99LF4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RtcbQ99LF4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms