Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reep3Q99KK1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms