Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdcbp2Q99JZ0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdcbp2Q99JZ0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdcbp2Q99JZ0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdcbp2Q99JZ0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdcbp2Q99JZ0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms