Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxp3Q99JB6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxp3Q99JB6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms