Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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