Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apobec3Q99J72 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apobec3Q99J72 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms