Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctu1Q99J10 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms