Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf112Q96DY5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms