Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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