Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sf3b5Q923D4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sf3b5Q923D4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sf3b5Q923D4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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