Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms