Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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