Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Smg8Q8VE18 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Smg8Q8VE18 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms