Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms