Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slf1Q8R3P9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slf1Q8R3P9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms