Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms