Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6bQ8K2H2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms