Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Abcf3Q8K268 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Abcf3Q8K268 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms