Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacs1Q8K212 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms