Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkn3Q8K045 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms