Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Q4Q8HWB2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms