Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Znf628Q8CJ78 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf628Q8CJ78 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf628Q8CJ78 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf628Q8CJ78 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Znf628Q8CJ78 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf628Q8CJ78 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Znf628Q8CJ78 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Znf628Q8CJ78 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Znf628Q8CJ78 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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