Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn2Q8CHX7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn2Q8CHX7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn2Q8CHX7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn2Q8CHX7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn2Q8CHX7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn2Q8CHX7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn2Q8CHX7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn2Q8CHX7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn2Q8CHX7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms