Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phc3Q8CHP6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phc3Q8CHP6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms