Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Wdr47Q8CGF6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms