Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Arhgap29Q8CGF1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Arhgap29Q8CGF1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Arhgap29Q8CGF1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Arhgap29Q8CGF1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap29Q8CGF1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap29Q8CGF1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Arhgap29Q8CGF1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Arhgap29Q8CGF1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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