Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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