Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Snx30Q8CE50 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Snx30Q8CE50 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Snx30Q8CE50 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx30Q8CE50 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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