Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc73Q8CDM4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc73Q8CDM4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms