Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms