Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Lrif1Q8CDD9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Lrif1Q8CDD9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrif1Q8CDD9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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