Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacnb2Q8CC27 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms