Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf2Q8CB19 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phtf2Q8CB19 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms