Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Atg4aQ8C9S8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg4aQ8C9S8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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