Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc159Q8C963 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms