Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Aph1bQ8C7N7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Aph1bQ8C7N7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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