Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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