Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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