Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trim35Q8C006 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms