Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Iffo1Q8BXL9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Iffo1Q8BXL9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Iffo1Q8BXL9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Iffo1Q8BXL9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Iffo1Q8BXL9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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