Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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