Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Als2cr12Q8BVM7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Als2cr12Q8BVM7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Als2cr12Q8BVM7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Als2cr12Q8BVM7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Als2cr12Q8BVM7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Als2cr12Q8BVM7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Als2cr12Q8BVM7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Als2cr12Q8BVM7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Als2cr12Q8BVM7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Als2cr12Q8BVM7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms