Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcl3Q8BVF2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms