Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp43Q8BUM9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp43Q8BUM9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms