Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQN9

C030005K15Rik, RIKEN cDNA C030005K15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C030005K15RikQ8BQN9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C030005K15RikQ8BQN9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms