Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms