Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4dQ8BGV9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms