Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms