Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmtc4Q8BG19 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms