Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms